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Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  32 lines
  1. *******************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 16 signature *
  3. *******************************************
  4.  
  5. It has been shown [1] that  the following  glycosyl hydrolases can be, on the
  6. basis of sequence similarities, classified into a single family:
  7.  
  8.  - Bacterial  beta-1,3-1,4-glucanases  (EC 3.2.1.73) (lichenases), mainly from
  9.    Bacillus but  also  from  Clostridium  thermocellum  (gene  licB)  and from
  10.    Fibrobacter succinogenes.
  11.  - Bacillus criculans beta-1,3-glucanase A1 (EC 3.2.1.39) (gene glcA).
  12.  - Lamarinase (EC 3.2.1.6) from Clostridium thermocellum (gene lam1).
  13.  
  14. Two closely clustered conserved  glutamate  have  been  shown [2], in Bacillus
  15. licheniformis lichenase, to be involved in the catalytic activity.  We use the
  16. regions that contains these residues as a signature pattern.
  17.  
  18. -Consensus pattern: E-[LIV]-D-[LIV]-x(0,1)-E-x(2)-G-[KRN]-x-[PST]
  19.                     [The two E's are active site residues]
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  24.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  25.  
  26. -Last update: June 1994 / First entry.
  27.  
  28. [ 1] Henrissat B.
  29.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  30. [ 2] Juncosa M., Pons J., Dot T., Querol E., Planas A.
  31.      J. Biol. Chem. 269:14530-14535(1994).
  32.